黔東南州中醫醫院系公立醫院，是本州唯一的一所三級甲等中醫醫院，是全州中醫、中西醫結合及民族醫藥醫療、教學、科研中心。系貴陽中醫學院第四附屬醫院、貴陽中醫學院碩士研究生培養單位。

全院現有在崗工作人員433人，其中正高職稱5人，副高職稱42人，中級職稱46人，初級職稱以下289人，行政管理人員23人，工勤人員28人;有省管專家1人，州管專家4人，州級拔尖人才4人。

門診部設有內科、外科、骨傷科、針灸科、皮膚科、婦產科、五官科、口腔科等診室;專設急診科;全院開設床位450張，設置10個病區，內一科、內二科、內三科、內四科、外一科、外二科、骨傷一科、骨傷二科、針灸科、婦產科。另設有藥劑科、檢驗科、功能科、胃腸鏡室、病理科、治未病科、輸血科、血液凈化中心、供應室、麻醉科、手術室等科室。設置17個行政管理科室。

全院擁有德國西門子高速磁懸浮64層螺旋CT機、多功能DR、CR數字X光機、C臂機、數字化多功能X線胃腸機、GE及西門子彩色B超、電子胃腸機、膀胱機、腹腔鏡、膽道鏡、輸尿管腎鏡及氣壓彈道碎石系統、鈥激光碎石系統、等離子前列腺電切儀、射頻消融熱凝儀、全自動生化檢測系統、高檔病理檢查系統以及臭氧治療儀、經絡導平治療儀、子午流注治療儀等一批中西醫診療設備。

內科方面以治療各種老年病、心血管系統疾病、呼吸消化系統疾病、糖尿病、肝病、風濕病為主。

婦產科方面可開展正常分娩接生、剖腹產、運用中醫中藥治療各種婦科疾病、不孕不育等。

外科方面可開展上下腹部、四肢、腦部等手術治療。針灸推拿理療治療中風后遺癥，特別是運用銀質針、小針刀、火針、浮針和三維正脊儀治療頸肩腰腿痛療效顯著。引進臭氧技術治療中風及其后遺癥，腰椎間盤突出癥，取得了很好的療效，填補了州內技術空白。

苗醫肺病科、針灸科是國家級重點建設?？?，苗醫肛腸科、眩暈病?？频?個?？剖鞘〖壷攸c建設?？?，苗醫脾胃病學科是省級重點建設學科。